Avant que Kazama Kimichika (Kimura Takuya) ne prenne son rôle d'instructeur à l'académie de police, il supervisait la formation des détectives débutants. Grâce à un système de formation appelé Kazama Dojo, de jeunes détectives inexpérimentés (Akaso Eiji, Aragaki Yui, Kitamura Takumi, Shiraishi Mai, Sometani Shota) seraient soudainement jumelés à Kazama et enseigneraient des compétences de détective à travers l'enquête sur des cas de meurtre réels. Les scènes de crime sont la salle de classe pour la formation en cours d'emploi. Kazama voit la vérité plus vite que quiconque. En exhortant les détectives juniors à penser par eux-mêmes, ils arrivent aux réponses et finissent par obtenir leur diplôme du Kazama Dojo un par un. Il deviendra clair comment Kazama est devenu une personne aussi impitoyable.

Abandonnant l'espoir de devenir mathématicien, le jeune Kitada Gaku se sent perdu jusqu'à ce que le chef étoilé Asakura Kai l'engage dans son restaurant et lui offre de nouvelles perspectives.

Kindaichi Hajime est un lycéen et un détective privé avec un QI de 180. Il résout des affaires de meurtre truffées d'indices difficiles. Kindaichi Hajime travaille avec son ami d'enfance Nanase Miyuki et Kenmochi Isamu. Kenmochi Isamu est maintenant l'inspecteur en chef du département de la police métropolitaine de Tokyo.

Le détective Ukyo Sugishita enquête sur les affaires criminelles selon ses propres méthodes. Ukyo sera accompagnés de différents partenaires au fil des saisons.

Quand un ami réapparaît dans sa vie après 12 ans d'absence, une procureure commence à relier des faits sans rapport pour découvrir la vérité sur la mort tragique de son père.