La vie de la jeune Fû, serveuse dans un salon de thé, est bouleversée quand elle croise le chemin d’un vagabond un peu sauvage, Mugen, et d’un mystérieux rônin, Jin. Elle voit très vite en eux une échappatoire à sa vie morose et leur propose un marché alors qu’ils sont sur le point d’être exécutés par l’administrateur local : elle promet de leur sauver la vie s’ils acceptent de voyager à ses côtés pour retrouver le mystérieux « samouraï qui sent le tournesol ».

Arimiya Kamoshige, un politicien malveillant, est gouverneur local depuis 40 ans. En abusant de son pouvoir, il a gagné des richesses et des femmes. Le père du protagoniste a géré l'argent noir d'Arimiya comme un bras droit, mais plus tard, il a été expulsé, accusé de faux crimes. Il s'est découragé et a appelé son fils en fuite, Tatsuya. Il a demandé à Tatsuya de prendre sa revanche sur Kamoshige. Bientôt, son père est mort et Kamoshige a engagé Tatsuya comme troisième secrétaire. Cependant, Kamo meurt également trois mois plus tard. Juste avant sa mort, il a changé le code d'un coffre-fort qui contient de l'argent noir caché. Ensuite, l'équilibre des pouvoirs de la famille Arimiya a changé. La personne qui obtient l'argent caché deviendra le prochain dirigeant. Alors que la famille Arimiya est en conflit pour l'argent caché, Tatsuya commence sa vengeance.

Souffre douleur pendant le collège, Kenichi Shirahama semble entrer sous les mêmes auspices au lycée… Mais un matin, sur le chemin le conduisant au lycée, il fait la rencontre de Fuurinji Miu, une nouvelle élève qui se révèle être une experte en arts martiaux. Afin de ne plus être un punching-ball vivant pour tous les voyous, Kenichi décide sous les conseils de sa nouvelle amie d'intégrer le dojo du grand-père de cette dernière. Il va devenir le seul disciple des plus grands maîtres de cinq disciplines que sont : le karate, la boxe thaï, l'aïkijutsu, le ninjitsu et le kung-fu. Ces maîtres se révélant un peu spéciaux, vont lui apprendre à se défendre et à ne plus fuir face à ses adversaires, et ce par tous les moyens…

Au milieu de la vie frénétique de Tokyo, la créatrice d'un personnage à la mode (le chien Maromi) est agressée devant chez elle par un jeune garçon portant une casquette, des rollers et une batte de base-ball dorés. Deux inspecteurs de police, l'un jeune et enthousiaste, son aîné plus blasé, mènent leur enquête pendant que de nouvelles agressions ont lieu, toujours par celui que l'on nomme "le jeune homme à la batte". Alors que les victimes ne semblent posséder aucun lien entre elles, la paranoïa s'installe au sein de la population de la capitale...

L'histoire se déroule quelque part dans les années 2020, onze ans après l'introduction des visières et lunettes de Réalité Augmentée (RA). Yūko Okonogi déménage avec sa famille à la ville de Daikoku, le centre technologique du monde mi-virtuel mi-réel. Elle rejoint l'« agence d'enquête » de sa grand-mère, formé d'enfants équipés d'outils virtuels et metatags puissants. Elle croise peu après Yūko Amasawa, une hacker experte de l'environnement virtuel qui cherche les pouvoirs d'une entité virtuelle mystérieuse appelée Michiko. Les protagonistes sont menés à démêler les mystères du monde virtuel dans l'ombre d'un hacker très puissant étant passé avant eux.

La Brigade des anges, une branche d'élite de l'armée de l'Empire Transbaal, est chargée de rechercher The Lost Technology, des objets mystérieux du passé qui détiennent des pouvoirs inconnus. Dirigée par le Colonel Volcott O 'Huey, qui s'apprête à prendre sa retraite, la Brigade des Anges se rend sur différentes planètes à l'aide de leurs vaisseaux Emblem Frame spécialement conçus à la recherche de Lost Technology. Malheureusement, ils gâchent souvent d'une manière ou d'une autre et finissent par se retrouver dans toutes sortes de situations embarrassantes et gênantes.

2436, les humains sont allés à la conquête de nouveaux systèmes solaires où ils ont établis des colonies. Thor et Rai sont deux jumeaux totalement opposés en caractère : le premier est un battant, ne se laissant commander par personne tandis que le second est un grand timide. Âgés de douze ans et fils d'éminents scientifiques, leur vie bascule le jour où en rentrant chez eux ils trouvent leurs parents morts. Ils sont alors kidnappés et se réveillent sur une planète complètement hostile, peuplée de plantes carnivores et de clans qui se livrent des guerres sans merci pour survivre. Ils réalisent rapidement qu'il s'agit d'une planète prison, effacée de tous les dossiers, où on envoie mourir les grands criminels et où seuls les plus forts peuvent espérer survivre. Le seul moyen de quitter la planète est de soumettre les quatre clans en devenant leur grand chef, le Jyu Oh Sei. Mais ils ne sont que des enfants et Thor comprend bien vite que ses chances de survie seront limitées tant que Rai sera dans ses jambes...

Une mystérieuse organisation s'intéresse à Shobu Kirifuda car ce dernier participe activement aux championnats de Duel Masters, le jeu de cartes dont il connaît les règles sur le bout des doigts. Il découvre un jour que ce jeu recèle de mystère et qu'il est possible de rencontrer les créatures imprimées sur les cartes. Grâce à ce pouvoir qu'il semble être le seul à posséder, il renforce ses connaissances en explorant les cinq civilisations qui forment la base du jeu. Il espère ainsi devenir le champion des Duel Masters, et peut-être retrouver la trace de son père disparu, un légendaire duelliste... Arrivera-t-il à devenir le prochain maître Kaijudo ?

Nana Komatsu, une jeune étudiante, décide de quitter sa ville natale pour partir rejoindre son petit ami Shôji, qui étudie dans une école d'art à Tokyo.  Dans le train à destination de la capitale, Nana Komatsu se retrouve à côté de Nana Osaki, une jeune fille qui se rend également à Tokyo pour réaliser son rêve de devenir chanteuse professionnelle, comme son petit ami Ren, le guitariste du groupe populaire"Trapnest". Les deux jeunes fille partageant le même nom vont rapidement se lier d'amitié bien que complètement différentes. Leurs chemins vont se croiser alors qu'elles cherchent à s'installer dans Tokyo et finissent par décider d'habiter un même appartement afin de se soutenir mutuellement dans leur amour et leur travail.

L'histoire se déroule dans un monde où certaines personnes ont le pouvoir de transformer des objets en d'autres objets : on les appelle les alchimistes. Cette transformation doit obéir à une certaine règle : l'objet transformé et l'objet issu de la transformation doivent être d'une masse équivalente. Edward Elric est, malgré son jeune âge, un fameux alchimiste qui a perdu son petit frère, Alphonse, lors d'une expérience de transmutation interdite. Il a cependant réussi à sceller l'âme de celui‑ci dans une grande armure en fer. L'aventure des deux frères commence quand ils décident de partir à la recherche d'un objet aux mystérieux pouvoirs, capable de les aider à retrouver leurs corps initiaux : la très convoitée pierre philosophale.

Étudiante et passionnée par les livres, Motosu Urano venait d'apprendre qu'elle allait enfin travailler comme bibliothécaire, ce dont elle avait toujours rêvé. Mais la vie en a décidé autrement et un tragique accident l'a emportée. Étudiante et passionnée par les livres, Motosu Urano venait d'apprendre qu'elle allait enfin travailler comme bibliothécaire, ce dont elle avait toujours rêvé. Mais la vie en a décidé autrement et un tragique accident l'a emportée.

Nous sommes en 2020. Les humains ne peuvent désormais plus se passer du réseau dans leur vie quotidienne. Mais ils ignorent que, de l'autre côté, existe le Monde Digital, un royaume entre ombre et lumière. Ils ne connaissent pas non plus l'existence des Digimon qui y vivent. Tout à coup, le réseau connaît plusieurs dysfonctionnements. Le jeune Taichi Yagami est resté chez lui pendant que sa mère et sa petite sœur sont parties pour le quartier de Shibuya. Mais leur train ne s'arrête plus et tandis que Taichi part vers la gare pour essayer de les sauver, un phénomène étrange le transporte dans le Monde Digital. Il fait alors la connaissance de son nouveau partenaire, Agumon…

Le destin de Takato Matsuda, Ruki Matsuno, et Lee Jenrya est bouleversé lorsqu'ils font la rencontre de "Digimon" réel, issu du jeu de carte auquel ils jouent. Chacun des enfants, appelés aussi, "Digimon Tamers", ont des opinions très différents sur la façon dont les 'digimons" doivent être traités...

L'histoire nous entraîne aux côtés Elaina, une sorcière voyageuse. Étant une voyageuse, elle a traversé de nombreux pays et rencontré beaucoup de personnes. Comme un pays n'acceptant que les magiciens, un géant aimant les muscles, un jeune homme voulant libérer son amoureuse de l'emprise de la mort, une princesse laissée seule dans un pays en ruine ainsi que sa propre histoire, du passé à aujourd'hui. Tout en rencontrant des personnes incroyablement étranges et en vivant de beaux moments, la sorcière continue son voyage.