Satoko est abusée depuis son plus jeune âge par son grand-père. Son amie d'enfance Yuri est au courant mais ne sait pas comment aider son amie. Lorsqu'elles rentrent au lycée, Satoko commence à avoir des mauvaises fréquentations et les deux adolescentes s'éloignent. Au même moment, Yuri se rapproche de Maho qui vient d'emménager dans le même immeuble. Un jour, alors que Maho est en train de se faire menacer par un homme avec un couteau, Yuri tente de l'aider et retourne l'arme contre l'agresseur avant de s'enfuir. Le lendemain, c'est pourtant Satoko qui se fait arrêter.

Yu travaille au centre des objets trouvés du Tokyo Metropolitan Police Department. Il est désormais affecté à la section no 12 de la 1re division d'enquête. L'équipe est connue comme une tombe pour les détectives, une voie de garage. Les membres actuels sont d'excellents détectives mais mis de coté. Ils ont des conflits les uns avec les autres, mais coopèrent et résolvent des cas difficiles.

C'est quasiment la guerre entre les lycées Tonko et Sanjo. Situés l'un à côté de l'autre, ils fonctionnent pourtant complètement différemment. Tonko est un lycéen pour garçons, fondé sur la doctrine zen et obtenant des résultats scolaires médiocres, alors que Sanjo est un établissement catholique pour filles qui a une plutôt bonne réputation. Seulement voilà, baisse de la natalité et crise économique obligent, une fusion entre les deux écoles, vieux serpent de mer jamais concrétisé jusqu'alors, est de plus en plus d'actualité. Malgré leurs dissensions, les deux directions se mettent finalement d'accord pour effectuer un test. Le professeur Hara Heisuke et quelques élèves de Tonko sont intégrés à une classe de Sanjo tandis que la professeure Hachiya Risa et la moitié de sa classe font le chemin inverse afin de vérifier si une cohabitation est possible.

Les officiers se sont préparés à l'accueillir le nouveau commissaire de la station de Kitamachi. Au même moment, un autobus est détourné par un homme armé d'un couteau. Aikawa Minori, une détective débutante a été expulsée du bus par un passager quand elle a essayé de désarmer le forcené. Mais le forcené conduit le bus à la station et se rend. Miniri passe alors les menottes au passager qui a fait entrave mais c'est le nouveau commissaire Toyama Kinshiro.

Après le meurtre de sa mère, Satoru retourne 18 ans en arrière pour tenter d'empêcher cette terrible tragédie et sauver la vie de ses trois camarades.

Aizawa Hinata est psychologue scolaire dans un lycée. Elle reste souvent le dernier recours pour des adolescents en détresse pris entre leurs problèmes à l'école et ceux à la maison alors qu'elle même a une relation difficile avec sa mère. Un jour, un lycéen régulièrement absent lui avoue avoir des sentiments pour elle. Le lendemain, il décède dans des circonstances troubles qu'Aizawa va s'efforcer de démêler.

Inami et Tamaru travaillent au sein de l'Équipe spéciale d'enquête de l'Unité mobile d'enquête de sécurité publique, une équipe composée de spécialistes ayant des compétences différentes. Inami s'attaque aux criminels physiquement, tandis que Tamaru attrape les criminels par déducrion. Ensemble, l'équipe s'attaque aux terroristes, aux nouveaux cultes religieux, aux espions militaires, aux organisations secrètes de narcotiques et aux politiciens complices.

An Toyoshima, 29 ans, est une jeune et très ambitieuse chef d'équipe de Horizon, la société de vente par correspondance en ligne qui propose une sélection de plus de 100 millions de marchandises. Elle se voit confier un projet qui met en jeu sa carrière.

Natsuko Kira était directrice de création dans une agence de publicité. Elle a travaillé très dur, mais elle est partie en congé de maternité. 3 ans plus tard, elle est de retour au travail. Natsuko veut travailler dans le département créatif où elle a travaillé auparavant, mais elle doit travailler dans le département des ventes. Ce qui l'attend, ce sont des employés qui ne lui font pas confiance. Elle est très occupée par son travail là-bas et elle doit aussi faire face à des problèmes à la maison.

Fujiwara Hana et Katayama Mizuki sont les meilleurs amis depuis l’école primaire. Lorsque Hana se fait larguer par son petit ami qui la trompait, Hana et Mizuki font un voyage ensemble pour soulager son chagrin. Ils rencontrent deux types – Narita Yosuke et Ichinose Ayumu – dans une auberge de source chaude à leur destination. Bien qu’ils viennent à peine de faire connaissance, Yosuke réprimande soudain Hana, qui n’a pas l’habitude de dire ce qu’elle pense. Au début, Hana se met sur la défensive. Mais elle commence à se rendre compte que son incapacité à s’exprimer parce qu’elle est trop attentive aux autres est un défaut et elle essaie de changer. D’autre part, Mizuki, qui n’a jamais eu de rendez-vous sérieux auparavant, veut être aimée. Yosuke est méprisé pour avoir dit des choses qu’il pense être pour le bien de l’autre alors qu’Ayumu est un mélange de gentillesse et de frivolité. L’amitié, la jalousie, la trahison et les querelles tourbillonnent dans chacun d’eux.

Après le retour d'Arata parmi le groupe, Fujio, Seiji, Shinya, Masaya, Madoka et Arata se retrouvent à nouveau tous les six pour déterrer leur capsule temporelle vieille de dix ans, contenant des lettres et les remplacer par des nouvelles pour le futur. À la suite de cela, le groupe devra faire face à une tragédie ainsi qu'à l'apparition d'un nouvel ennemi.