Touma et Index rencontrent Arisa, une chanteuse dont les pouvoirs sont liés à un ascenseur spatial presque complet et à un mystérieux accident survenu trois ans plus tôt.

Il s'agit de la première partie des deux films. Ce film récapitule la série entièrement du point de vue de Kuriyama Mirai.

L'histoire prend place quelques mois après la conclusion de l'anime Beyond the Boundary.

Dans un monde virtuel constitué d'une multitude de dimensions, Dual et Dorothy ont pour mission d'éradiquer les virus qui menacent chacun de ces espaces. Et la règle est simple : tout monde infecté doit être systématiquement détruit. C'est leur travail, et elles seules en ont la responsabilité. Un jour, Dual et Dorothy découvrent une jeune fille attaquée par des virus. Elles parviennent néanmoins à la sauver, mais cet être semble rempli de mystère. Qui est-elle ?

Quatre lycéennes en uniforme marchent silencieusement sur une terre stérile. Ces filles sont des voyageuses temporelles qui ont été envoyées 6000 ans dans le futur, où le même jour est sans cesse répété, afin d'échapper à l'extinction humaine. Elles ont étudié le voyage temporel à l'école, ont été examinés et ont été envoyées dans le futur comme on leur avait dit. Que doivent-elles faire maintenant ? Elles en n'ont aucune idée. La seule chose qu'elles pouvaient emporter avec elles dans le futur était une torche et une sorte de téléphone portable qui ressemble à un jouet. Bien entendu, il ne reçoit aucun signal dans le futur. Au cours de leur marche, les filles voient d'étranges oiseaux volant dans le ciel et une rivière décolorée au loin. Puis, une jeune fille découvre une maison abandonnée et reconnaît le nom inscrit sur la porte d'entrée...

Alors que la cérémonie de graduation des troisième années se terminent, le groupe µ's s'était fait à l'idée que son parcours s'arrêterait là. Effectivement, trois de leur membres qui étaient en troisième année viennent d'être gradués du lycée et n'ont donc plus le statut de School Idol : il leur est donc impossible de continuer leur activité au sein du groupe. Néanmoins, Koizumi Hanayo reçoit soudainement un message très surprenant qui marque alors le début d'un nouveau départ pour le groupe !

Épisode spécial annoncé lors de l'AnimeJapan 2016. L'histoire prend place juste avant le festival de l'école et se centre cette fois sur Aya, ses souvenirs du collège et sa relation avec Yōko, mais surtout Shino. "Récemment, quelque chose me trotte dans la tête... Shino et moi sommes amies depuis le collège. Seulement... Je ne suis pas son amie d'enfance, comme Yôko, et je ne suis pas blonde, comme Alice et Karen. Peut être que pour Shino je ne suis pas une amie aussi importante que je ne le pense."

Un film qui continue les aventures de Kokoa, Chino, et le reste des filles de Rabbit House après la saison 2

Cet épisode bonus accompagnant le film Mirai Fukuin nous raconte différentes petites histoires se plaçant à diverses dates par rapport à l'intrigue principale. Elles sont centrées sur divers personnages.