Depuis sa rencontre avec un médecin de son quartier, Shindo Minato rêve de devenir docteur et spécialement pédiatre. Autiste, il souffre aussi du syndrome du savant et maitrise parfaitement l'anatomie dès l'âge de sept ans. Malgré ses quelques difficultés sociales, Minato termine sans encombre ses études de médecine et sort même major de sa promo grâce à ses extraordinaires capacités de mémorisation. Il intègre le département de pédiatrie d'un hôpital où son attitude particulière ne va pas passer inaperçue.

Chiaki Shinichi est le meilleur pianiste de l'université Momogaoka. Mais lui rêve depuis tout petit est de devenir chef d'orchestre. Un problème : suite à de mauvaises expériences, il a développé une grande peur des voyages en avion ou en bateau. Il se sent donc piégé au Japon et ne sait pas jusqu'où il pourrait aller. De plus, il tient à apprendre le métier avec Sebastiano Viera, un chef d'orchestre qu'il a pu côtoyer enfant. Dans cette université, il y a aussi une fille bizarre, surnommée Nodame (Noda Megumi). Un jour, elle retrouve un jour un Shinichi ivre et endormi à côté de chez elle et le recueille pour la nuit. Ce dernier est alors réveillé par le son du piano de Nodame... et se retrouve en plein milieu d'un appartement qui pourrait s'apparenter à une décharge. Après s'être remis du choc, il remarque quand même que parmi tous les mauvais musiciens entendus au Japon, elle sort du lot. Shinichi se dit qu'il a peut-être quelque chose à faire au Japon...

Le gouverneur de Tokyo est dérangé par un article de journal étranger. L'article souligne le manque de femmes cadres dans le département de la police de Tokyo. Pour dissiper ce type d'image négative, le Gouverneur crée la Section de la N.- S. et nomme Izumi Demachi détective de sexe féminin, à la tête de ce département. Le détective An Narutaki se joint au NS Gakari en tant que membre. Elle est enthousiaste dans son travail mais était discriminée parce que c'est une femme.

Né dans une famille aisée, Sakurako est une belle femme et elle a un tempérament vif. Mais elle a une attitude générale brutale. En tant qu'ostéologue, elle reconstitue les restes osseux d'animaux dans son atelier à la maison. Elle est passionnée par les ossements. "Les cadavres parlent avec éloquence ", dit-elle. Elle observe très attentivement les corps et les scènes de crime. Kujo Sakurako, ostéologue, résout les affaires en entendant la "voix" des os.

Le premier amour de Naoko, étudiante en médecine, est son oncle Masato. Pour se rapprocher de lui, elle est admise dans une prestigieuse école de médecine à Tokyo. A l'école de médecine, Naoko rencontre Aya - la fille du directeur de l'hôpital et aussi une chercheuse talentueuse à l'école. Aya est aussi la petite amie de Masato. Pour la première fois de sa vie, Aya commence à ressentir de la frustration quand Naoko retrouve Masato...

Aoi Midori est pharmacienne et, au cours de ses huit années de carrière, elle a travaillé selon sa conviction profonde que "l'on doit bien connaître le patient pour lui prescrire le bon médicament, car le médicament est le lien qui relie l'aujourd'hui du patient à sa vie quotidienne à venir". Pour cette raison, Aoi prend généralement beaucoup de temps dans ses consultations avec les patients, ce qui lui vaut d'être critiquée par ses collègues pour son manque d'efficacité dans son travail. Aoi fait fi de ces plaintes car son objectif est d'aider les patients à retrouver la vie quotidienne qu'ils considéraient autrefois comme acquise.

Yu travaille au centre des objets trouvés du Tokyo Metropolitan Police Department. Il est désormais affecté à la section no 12 de la 1re division d'enquête. L'équipe est connue comme une tombe pour les détectives, une voie de garage. Les membres actuels sont d'excellents détectives mais mis de coté. Ils ont des conflits les uns avec les autres, mais coopèrent et résolvent des cas difficiles.

L'Hôpital Général de Donoue est confronté à un déficit budgétaire, même si les médecins conduisent des voitures importées coûteuses et mènent une vie farfelue. Le chef de bureau Momoi recrute le chirurgien Kosuke Sagara sur un site Web médical. Kosuke Sagara arrive à l'hôpital et dit au directeur de l'hôpital général de décider de son salaire après avoir vu son travail. Kosuke Sagara informe l'hôpital qu'il avait précédemment quitté son emploi dans un hôpital universitaire et pris une année sabbatique.

Satoshi Itomura est méticuleux sur les scènes de crime pour appréhender les auteurs de crimes. Il cherche la solution au travers des biens de la victime. Il es mal vu par ses collègues de la première division car il mène des enquêtes sans autorisation et en dehors de toute hiérarchie. Miyuki Oda, enquêteuse débutante, va découvrir par le détective scientifique une autre manière de résoudre des crimes.

Le détective Ukyo Sugishita enquête sur les affaires criminelles selon ses propres méthodes. Ukyo sera accompagnés de différents partenaires au fil des saisons.

Thug Daichi est libéré de prison où il a été incarcéré pour tentative de meurtre. Il est apathique et ne travaille à aucun avenir. Il découvre qu'une femme avec qui il a eu des relations sexuelles a donné naissance à une fille. La jeune fille a un cancer, est hospitalisée et a besoin d'une greffe de moelle osseuse. Daichi se rend à l'hôpital et un test révèle qu'il est compatible. Cependant, il est à nouveau arrêté avant d'avoir eu la chance d'aider sa fille mourante...

Inami et Tamaru travaillent au sein de l'Équipe spéciale d'enquête de l'Unité mobile d'enquête de sécurité publique, une équipe composée de spécialistes ayant des compétences différentes. Inami s'attaque aux criminels physiquement, tandis que Tamaru attrape les criminels par déducrion. Ensemble, l'équipe s'attaque aux terroristes, aux nouveaux cultes religieux, aux espions militaires, aux organisations secrètes de narcotiques et aux politiciens complices.

Shiba Kengo, est un jeune chirurgien au cœur pur qui se consacre à son travail. Il est transféré d'un prestigieux hôpital universitaire à un hôpital en difficulté financière, mais c'est là qu'il rencontre Kasugai Yuka, un infirmier en chef compétent et posé, qui lui apprend la réalité du monde médical. Kengo pur doit faire face à divers obstacles et défis alors qu'il arrache les "masques" des professionnels respectés - médecins, infirmières et éducateurs - et découvre leur vraie nature.

Le monde est tourmenté par Shocker, une mystérieuse organisation terroriste, qui recrute ses agents en kidnappant des personnes qu'ils transforment en mutants cyborgs. Takeshi Hongo, l'une des victimes, se rebelle juste avant la phase finale de sa transformation. A l'aide de ses nouveaux pouvoirs, il décide de combattre Shocker...

Situé dans le quartier de Shinjuku, le propriétaire d'un Izakaya, connu par ses clients sous le nom de "Master", ouvre son restaurant de minuit à sept heure du matin. Son menu est limité à du tonjiru (soupe miso au porc), de la bière, du saké et du shochu. Cependant, il est prêt à cuisiner tout ce que ses clients lui demandent à condition qu'il ait les ingrédients à sa disposition. Chaque épisode se concentre sur un client, sa relation avec un plat et un conflit personnel à résoudre, certains plus lourds que d'autres. La clientèle du petit restaurant est représentative de la variété du très dense quartier de Shinjuku. D'anciens acteurs, des hommes d'affaire, des danseurs exotiques, des directeurs de films ainsi que des drag-queens viennent se retrouver dans cette oasis de chaleur et de calme qui contraste avec l'ambiance des rues de Shinjuku.

Dans un système judiciaire où la quasi-totalité des prévenus sont condamnés, un avocat parvient à déjouer les pronostics pour ses clients, malgré des preuves accablantes.