Le film suit Alice Liddell, la jeune fille qui avait inspiré Les Aventures d'Alice au pays des merveilles à Lewis Carroll, qui est devenue une femme âgée. Les personnages du conte, qui auparavant l'amusaient tant, sont devenus dans son esprit plus obscurs et commencent même à la hanter. Se replongeant dans son passé, elle repense à sa relation privilégiée avec le timide écrivain, en l’envisageant maintenant sous un angle nouveau, auquel son âge lui permet désormais d’accéder...

Dans une forêt merveilleuse, une petite fille va faire l'expérience de la vie et découvrir que les choses ne sont pas toujours ce qu'elles semblent l'être. Vivant seule avec sa mère, Linet passe ses journées à explorer les bois alentours, dont elle connaît les moindres recoins. Mais un jour, alors que la petite file se rend chez sa grand-mère, ce qui ne devait être qu'une simple promenade va se transformer en un voyage périlleux lorsqu'elle trouve sur son chemin un seigneur maléfique et un loup aussi enchanteur que féroce…