Quatre amis du premier film sont de retour. Cette fois-ci, ils ne retournent pas seulement dans le grand monde du sexe, mais ils aident aussi l'État dans sa mission importante.

Tex Richman est un homme d'affaire qui compte acheter le théâtre des Muppets. Gary, Marie et Walter la marionnette se mettent alors à la recherche des anciens du théâtre, séparés depuis plusieurs années, afin de tenter de sauver cet endroit qui leur est très cher. Ils arrivent à retrouver Kermit la grenouille qui part à son tour dans le but de réunir ses anciens compagnons de scène.