Bingo est un gangster de bas niveau qui se retrouve les deux pieds dans le ciment après avoir eu une aventure avec Mari, une fille de scène qui est en fait la petite amie de son boss Teshio. Pour échapper à sa sentence, il le bluffe en lui indiquant qu'il connait bien le notoire Della Togashi, un célèbre tueur à gage. Le problème est qu'il ne connait pas vraiment ce Della Togashi donc pour sauver sa peau, il recrute un acteur déchu, Taiki Murata, en se faisant passer pour un réalisateur de film. Ainsi se met en place une véritable comédie à double sens opposant un mafieux à un pseudo tueur à gage.

Rui est une jeune femme tokyoïte désœuvrée en quête de sensations fortes. Un soir, elle rencontre dans un bar Ama, un punk à la langue fendue comme un serpent qui la courtise et l'impressionne. Rui est tout à coup intriguée par son univers des transformations corporelles, entre les tatouages et les piercings et elle rencontre peu après Shiba, le tatoueur d'Ama. Après s'être convaincu d'obtenir une langue fendue comme celle de son petit ami, Rui décide également de se faire tatouer un dragon mêlé d'un kirin (une sorte de lion légendaire japonais) par Shiba. Celui-ci demande en retour de lui faire l'amour. Elle découvre alors les délices du sadomasochisme et poursuit sa double relation entre le punk et le tatoueur jusqu'au jour où Ama disparaît.

Sous le règne du huitième shogunat des Tokugawa, le domaine de Yunagaya, dans la région de Tohoku, est un petit fief dont le daimyo est Masaatsu Naito. Le daimyo reçoit l'ordre d'exécuter le Sankin-kotai dans les 5 jours . Le Sankin-kotai est une coutume qui exige que le daimyo du fief rende hommage au shogun à Edo sous peine de represailles. Malheureusement, le temps nécessaire à Masaatsu Naito pour faire le trajet est de 8 jours. Cet ordre est émis parce qu'un haut fonctionnaire du gouvernement veut s'accaparer la mine d'or présente sur le fief. De plus, les dépenses pour Sankin-kotai sont élevées et le domaine est si petit qu'il semble impossible à compléter. Néanmoins, Masaatsu Naito commence une opération inattendue pour achever Sankin-kotai en 5 jours.

Masaatsu Naito (Kuranosuke Sasaki) termine avec succès le Sankin-kotai (rituel requis pour visiter le shogun). Sur le chemin du retour, il apprend qu'une insurrection de paysans a eu lieu dans sa ville natale de Yunagaya. Masaatsu Naito sait que c'est une contre-attaque de Matsudaira. Il revient à Yunagaya, mais constate que son château a disparu.

À la fin du 16ème siècle, après la mort de Nobunaga Oda, Hideyoshi Toyotomi prend le pouvoir. La guerre est sur le point de se terminer, mais le pouvoir de Hideyoshi Toyotomi rend la vie difficile pour les gens. Le moine Senko Ikenobo est un maître de l'arrangement floral. Il prie pour la paix dans le monde et essaie de donner de l'espoir aux gens avec son art. Il devient ami avec Rikyu qui est un moine et un politicien. Rikyu est contraint au hara-kiri sur ordre de Hideyoshi Toyotomi. Senko Ikenobo défie Hideyoshi Toyotomi.

L'histoire débute après les événements d'Alabasta. Après avoir rencontré d'étranges chercheurs de trésor, qui leur racontent la légende d'une cité perdue dans les nuages, Luffy et son équipage décident de s'y rendre et découvrent ainsi une civilisation unique.

Dans cet épisode, Luffy et son équipage retrouvent Foxy qui veut se venger au Nouveau Monde, ce qui entraînera les deux équipages dans un combat contre la Marine.