À bord du navire qui l'emporte vers la région du Mont Fuji, Zatoichi s'immisce dans une partie de dés. Avec sa ruse habituelle, il dépouille une bande de yakuzas. Sitôt débarqué, ces derniers vont tendre un piège au masseur roublard. L'affrontement tourne court mais blesse accidentellement la fillette d'une artiste ambulante. Embarrassé, Zatoichi promet à la mère de gagner l'argent nécessaire à l'achat du coûteux remède qui pourra sauver l'enfant de la gangrène. Il est aidé en cela par Tadasu Jumonji, un samouraï errant pour lequel il s'est pris d'amitié au cours de la traversée : car celui-ci est amateur d'échecs, jeu qu'affectionne aussi le masseur. Leur mission accomplie, les deux hommes continuent de cheminer ensemble vers le Mont Fuji, prétextant la moindre halte pour tâter de l'échiquier...

Une vieille dame reçoit un courrier envoyé par un inconnu. Elle se rend vite compte qu’il s’agit de l’histoire de son ami Sota et d’elle, Sayo, à l’époque de leurs 10 ans. Sota vivait avec son grand-père et son chien Chibi dans un petit village enneigé. Pauvre, il n’avait pas les moyens d’envoyer son petit-fils à l’école mais il veilla à sa bonne éducation. Bien que les conditions de vie furent rudes, Sota aspirait à devenir peintre. Sayo, son amie d’enfance, était issue d’une famille aisée et son père comptait bien mettre fin à leur amitié.

Otsuya, femme rebelle et déterminée, fuit sa famille pour se marier avec Shinsuke, un simple commis, contre l'avis de ses parents qui n'acceptent pas cette relation. Les deux amants trouvent refuge chez un ami de la famille, Gonji, mais ce dernier les trahit. Il organise l'assassinat de Shinsuke pendant qu'Otsuya est vendue à la maison de geishas de Tokubei. Comme symbole d'humiliation, Seikichi, un mystérieux tatoueur, lui grave une araignée dévoreuse à tête humaine sur le dos. Petit à petit, Otsuya se laisse envahir par l'esprit du tatouage et donne libre cours à ses pulsions vengeresses...

Takuma est un jeune garçon souvent hospitalisé. Il est suivi par un cardiologue, qui a lui-même une fille, Mayu. Les deux enfants se lient d’amitié et nourrissent des sentiments l’un pour l’autre. Ils vont jusqu’à se promettre le mariage… malheureusement, le cardiologue annonce que le jeune garçon ne vivra pas, passé l’âge de 20 ans.

Le dernier samouraï qui a dirigé une armée de 690 contre un ennemi de 50 000 - En 1867, le pouvoir politique est revenu à l'empereur et 260 ans du shogunat Tokugawa ont pris fin, entraînant la division des domaines soit en armée de l'Est, soit en armée de l'Est. Armée de l'Ouest. En 1868, la bataille de Toba-Fushimi déclencha la guerre de Boshin. Tsuginosuke Kawai, le principal vassal d'un petit domaine à Echigo appelé Nagaoka, a décidé de n'appartenir à aucune armée et de pratiquer la « neutralité armée ». La bataille était la norme à l'époque des samouraïs, mais il sentait fortement que la guerre n'était pas la solution et qu'elle ne pouvait pas protéger les citoyens.

Kentaro, un jeune étudiant et sa soeur aînée Keiko se décident à faire des recherches sur leur grand-père Kyuzo Miyabe, tué alors qu’il était dans les Forces Spéciales lors de la seconde guerre mondiale. Leur grand-père Kyuzo Miyabe était terrifié par la mort et obsédé par la vie. Pourquoi a-t-il rejoint les forces spéciales ? Selon ses compatriotes, des soldats marines, Kyuzo Miyabe était un génie et aussi un lâche. Kentaro et Keiko découvrent alors la vérité choquante qui est restée scellée pendant 60 ans.