Une voiture heurte un objet invisible; le sang se répand à partir d'une source invisible qui devient visible lorsque l'homme qui saigne, meurt. Il porte avec lui une note de suicide dédiée à son seul ami, qui est aussi un homme invisible. Un jeune reporter passionné traque Takemitsu Nanjo, un vétéran de la guerre qui gagne visiblement sa vie en se peignant le visage comme celui d'un clown et en portant des pancartes publicitaires. Son voisin préféré est une petite fille aveugle dont la mère se heurte à des gangsters locaux. Les gangsters terrorisent la ville en tant que "gang invisible", s'enveloppant dans des écharpes et des trench-coats afin d'être visibles pour leurs victimes, même s'ils sont censés être invisibles en dessous. Une fois qu'ils découvrent Nanjo, qui défend ses seuls amis, ils le battent et le laissent pour mort.

Takezo, rebaptisé Musashi Miyamoto, est devenu un samouraï hors pair. Depuis des années, il parcourt le pays au gré de ses affrontements dont il sort toujours vainqueur. Le voici désormais à Kyoto pour combattre maître Yoshioka. Dans la grande ville, il retrouve ses deux soupirantes : la vertueuse Otsu, ancienne fiancée de Matahachi, et la jeune Akemi, également courtisée par Yoshioka. Alors que l’affrontement entre les deux hommes est sans cesse repoussé, la violence autour de Musashi ne fait que croître...