L'action se déroule à Paris et l'inspecteur Zenigata vient d'apprendre que le trésor des Bourbons vient d'être dérobé par Lupin ! Il s'en va immédiatement à sa poursuite et découvre à sa grande surprise que le conducteur du camion contenant les bijoux volés n'est pas Lupin. En effet, il s'agit d'une jeune femme blonde dont on apprendra plus tard le prénom, Becky. Toutefois, la bande à Lupin, n'ayant pas l'intention de se faire griller au poteau par une inconnue, décide de lui reprendre le trésor. Lupin pense avoir réussi son tour de force, malheureusement il se fait kidnapper en plein vol ! Il ne connaît rien de son ravisseur, à part qu'il fume des Gauloises et qu'il exige de notre gentleman cambrioleur le vol d'un bijou maudit (maudit parce que tous les voleurs qui l'ont eu entre les mains sont morts), le Bull's Eye. Pire, si il n'obtempère pas, il verra mourir sa bien-aimée Fujiko, dont il découvre ainsi la captivité.

Dans un Tokyo futuriste, des policières combattent un monstre. L'une d'entre elles, Katsumi Liqueur, se souvient de l'endroit où elle l'a déjà vu…

La princesse Rangiku a perdu toute sa famille aux mains du seigneur Karimata, qui a envahi sa maison en quête de l'œuvre de son père, des marionnettes aux capacités uniques. Comme il se doit, Rangiku part avec trois des plus grands guerriers marionnettistes de son père pour se venger. Elle peut les manipuler pour affronter les guerriers les plus puissants, mais la manipulation des marionnettes la rend vulnérable aux attaques directes. Elle cherche donc un guerrier ninja nommé Manajiri pour l'aider et la protéger dans sa quête.

Des meurtres en série dont les victimes sont des policiers provoquent un gros tremblement de terre à la préfecture de police. Face à Kogoro qui tente de recueillir des informations sur les faits, l'inspecteur Maigret reste étrangement silencieux. Conan, qui a vu ce qu'il se passait, suspecte un lien entre les événements et la police. Mais voilà que l'inspecteur Satô se fait tirer dessus ! Ran se trouve par hasard sur les lieux. Elle est tellement choquée qu'elle en perd la mémoire... Et ce n'est pas tout : le meurtrier n'en veux qu'à une seule cible : Ran !! Sachant le danger qu'elle court, Conan vole au secours de Ran et s'engage seul dans l'enquête...

L'oncle de Sonoko Suzuki, Jirokichi, a invité Conan et ses amis dans le plus grand dirigeable au monde, le Bell Tree, où se trouve un diamant d'une valeur inestimable. Tout ceci n'est que ruse afin de pouvoir enfin capturer le célèbre Kaito Kid. Mais de mystérieux terroristes armés jusqu'aux dents font irruption, et injecteront un virus mortel dans le dirigeable si leurs requêtes se sont pas satisfaites. Conan et ses amis sont piégés, commence alors une bataille pour survivre ! Pourront-ils sortir de cette situation ?

Un jour de décembre, le gouverneur Asakura, qui a été réélu comme Gouverneur de Tokyo, reçoit une mystérieuse lettre d'avertissement. Celle-ci menace de faire sauter le tout nouveau tunnel souterrain municipal qu'il doit inaugurer le lendemain. Heureusement, Conan en entend parler par Kogoro, et en voyant une mystérieuse personne dans le tunnel, il arrive à prévenir les passagers du train et il n'y a aucune victime après l'explosion de plusieurs bombes. La police a beaucoup de mal à désigner un suspect, mais une autre construction initiée par Asakura est menacée. Qui est le poseur de bombes et l'assassin d'Hikawa ? Qu'est-il vraiment arrivé au fils de Fuyumi ? Conan et les détectives boys veulent résoudre ces mystères, mais attention ! Quelqu'un les suit à la trace, et en montagne, si on reste quinze minutes sous une avalanche, on meurt ! De nombreux dangers les attendent ! Sauront-ils les surmonter ?

Songohan et Oolong se promènent tranquillement à la montagne jusqu'au moment où les deux compères se font attaquer par une bande de démons. Avec l'aide de Piccolo, Songohan s'en sort in extremis. Par la suite, Bulma et Tortue Géniale se font enlever par le même groupe de monstres. Songoku, inquiet, part à leur recherche et se retrouve confronté aux géants du docteur Willow et du docteur Kôchin, et à leur terrible dessein...

Hiromi Oka, élève du lycée Nishi, s’inscrit au club de tennis par admiration envers la joueuse la plus douée de l’établissement, Reika Ryûzaki, surnommée “Madame Butterfly”. Le nouvel entraîneur, Jin Munakata, impose ses méthodes particulières et, contre toute attente, choisit Hiromi pour faire partie des titulaires de l’équipe…

À bord d'un luxueux bateau, Conan et toute sa petite troupe au grand complet voguent au grès de cette paisible croisière. Bien évidement, un évènement viendra rapidement briser cette utopique félicité : le meurtre de l'un des passagers. Cet incident déclenchera une réaction en chaîne allant crescendo jusqu'à mettre en péril la vie des 600 passagers.

L'histoire de quatre meilleurs amis et de leur vie à l'université et en dehors. Soudain, l'un d'entre eux reçoit une offre surprenante pour devenir une star de cinéma.