Une jolie maison au bord d'un lac, un drapeau de la Suède flottant au vent... Tel est le décor du milieu de l'été, pour Emil et ses amis. Mais chacun a ses problèmes personnels à résoudre. Micke s'inquiète pour sa femme enceinte, et passe son temps à calculer les trajets les plus rapides pour se rendre à la clinique. Eva cherche à s'amuser pour se remettre de sa séparation avec Patrick et Sam. Quant à Anders, le musicien, il s'inquiète de ne pas réussir à concevoir un enfant avec sa petite amie Maria.

Christoffer est l'heureux propriétaire d'un restaurant à Stockholm mais voit sa vie bouleversée lorsque son père meurt et que sa mère lui demande de reprendre l'affaire familiale, une grande entreprise nommée Borch Moller.

Jeux Olympiques de Munich, 5 septembre 1972. Un commando de terroristes palestiniens prend en otages puis exécute 11 membres de l'équipe sportive israélienne, sous l'œil des téléspectateurs du monde entier. Inspiré de faits réels, Munich retrace le parcours de 5 agents israéliens chargés de traquer les 11 palestiniens considérés comme les commanditaires de l'attentat. Pour mener à bien cette mission, les 5 hommes devront renoncer du jour au lendemain à leur identité, et s’exposer à tout moment à la vengeance de leurs cibles.