Bloom, une fille ordinaire de la planète Terre, vit une vie normale dans la ville de Gardenia jusqu'au jour où elle rencontre Stella, princesse de la planète Solaria en danger. En allant la secourir, Bloom découvre qu'elle possède des pouvoirs magiques. Stella la persuade de rejoindre Alféa, la plus grande école de fées de tout le royaume. Là-bas, Bloom crée le Winx Club composé de ses quatre amies et camarades de chambre : Stella, Musa, Tecna, et Flora. Elles se lieront ensuite d'amitié avec les Specialistes, Brandon, Riven, Timmy, et Sky, dont elles tomberont amoureuses. Le Winx Club rencontrera également un trio de sorcières de la Tour Nuage : Icy, Darcy et Story, mieux connues sous le nom des Trix. Ces dernières recherchent le pouvoir de la flamme du dragon, et leur quête infernale les opposera au Winx Club. Bloom commence également à lever le voile sur les secrets qui planent sur sa planète, ses parents et ses pouvoirs.

Ils sont six et forment une belle équipe de super-héros. Fulmen est capable de faire tomber les éclairs du ciel, Nix laisse tomber la neige, Nubess contrôle les nuages, Pluvia sait faire tomber la pluie, Thermo a le pouvoir de changer la météo et Ventum parvient à déclencher le vent. Chacun d'entre eux utilise ses super-pouvoirs pour contrôler les phénomènes météorologiques...