Les vacances s'achèvent pour Ben Tennyson, sa cousine Gwen et leur Grand-père Max. A la fin de l'été où Ben a découvert l'Omnitrix tous trois retournent pour la rentrée à leur ville natale de Belwood, au désespoir de Ben, qui doit donc arrêter de jouer les super-héros pour reprendre une vie normale. Cependant, cette fin n'est pas aussi calme qu'il l'aurait cru : Eon, un très ancien extra-terrestre capturé jadis par les Plombiers, s'échappe de sa prison. Il souhaite à présent retrouver Ben et l'Omnitrix pour un plan destiné à permettre une invasion de son peuple sur Terre...

Le 28 juin 2005, un commando de quatre Navy Seals prend part à l'opération «Red Wing», qui a pour but de localiser et éliminer le leader taliban Ahmad Shah. Mais rapidement repérés et encerclés, les quatre soldats vont se retrouver pris au piège.

Abandonné par sa mère peu après avoir immigré aux États-Unis, Gon grandit au sein de la mafia et devient un tueur à gages sans pitié. Quoique généralement irréprochable quand il s'agit d'éliminer sa cible, Gon fait un jour une terrible erreur et tue une petite fille. Submergé par le regret, la culpabilité et la honte, il veut quitter le métier mais son patron lui donne une dernière mission. Gon revient en Corée du Sud, sur la terre de sa mère qui l'a oublié, afin de tuer sa toute dernière cible... qui se révèle finalement être Mo Gyeong, la mère de la petite fille morte.

Donny, jeune au passé tumultueux, danse dans les rues de la Nouvelles-Orléans pour vivre. Il rejoint Nick à New York, son frère adoptif, pour travailler dans un club, le "Static", où il participe à des chorégraphies d'une nouvelle danse. Mais les deux garçons vont se retrouver au milieu d'une guerre de gangs menée par le leader japonais Kaz, ancien ami de Nick. Kaz a une soeur, Aya, dont les papiers vont bientôt expirer. Elle risque de repartir dans son pays. Donny va tomber amoureux d'Aya.

En 1986, des ados d'origine coréenne ayant grandi à l'étranger partent en colonie de vacances à Séoul pour en apprendre davantage sur leur héritage culturel.