Il y a 12 000 ans, une guerre commence et oppose les anges déchus d'Atlantis, gardiens de l'Arbre de vie, aux humains. Pendant cette bataille, un ange déchu nommé Appolonius et surnommé aussi "Les Ailes du Soleil" avait trahi les siens pour l'amour d'une humaine, Siren. Pour protéger les humains, il prit les commandes d'un mecha, nommé Aquarion, et remporta la bataille. Cependant, longtemps après cette bataille, le conflit se reproduisit. Afin d'assurer la sécurité de l'humanité, un groupe de protection lutte contre les invasions répétées des anges déchus, qui s'emparent de l'énergie vitale des humains, pour nourrir leur Arbre de vie. Grâce aux vectors, un type d'Aquarion peut être alors crée (Solar, Luna, ou Mars) et contrôlé par des pilotes possédant des pouvoirs particuliers. Mais qui sont réellement ces pilotes ?

La difficile bataille des 13 filles de Talent Production 765 qui rêvent de devenir un jour idoles dans l’industrie de l’animation japonaise...

Akari et Hiroyuki sont des amis d'enfance qui étudies dans le même lycée, mais Akari a un faible pour Hiroyuki depuis que celui-ci l'aidera à ramasser ses affaires de classe tombées par terre dans un jour de pluie. Par contre, Hiroyuki ne remarque pas celle qui vient le réveiller tous les matins et qui lui permet d'être tous les jours à l'heure au lycée.

2436, les humains sont allés à la conquête de nouveaux systèmes solaires où ils ont établis des colonies. Thor et Rai sont deux jumeaux totalement opposés en caractère : le premier est un battant, ne se laissant commander par personne tandis que le second est un grand timide. Âgés de douze ans et fils d'éminents scientifiques, leur vie bascule le jour où en rentrant chez eux ils trouvent leurs parents morts. Ils sont alors kidnappés et se réveillent sur une planète complètement hostile, peuplée de plantes carnivores et de clans qui se livrent des guerres sans merci pour survivre. Ils réalisent rapidement qu'il s'agit d'une planète prison, effacée de tous les dossiers, où on envoie mourir les grands criminels et où seuls les plus forts peuvent espérer survivre. Le seul moyen de quitter la planète est de soumettre les quatre clans en devenant leur grand chef, le Jyu Oh Sei. Mais ils ne sont que des enfants et Thor comprend bien vite que ses chances de survie seront limitées tant que Rai sera dans ses jambes...

Maintenant diplômés, une bonne partie des membres du Genshiken ont laissé un vide derrière eux après leur départ que Ogiue, la nouvelle présidente du club, doit essayer de combler. Avec Ohno, Sue et Kuchiki, elle tente de trouver le meilleur moyen d'attirer du monde lors de la journée consacrée aux nouveaux étudiants. Grâce à ses talents de dessinatrice et au cosplay, trois nouvelles têtes rejoignent l'aventure dont Hato, un jeune garçon qui aime s'habiller en fille. Une nouvelle génération, plus féminine que jamais, se met ainsi en marche.

Dotées d'ailes et d'une auréole tels des anges, les Ailes Grises (ou Haibane) vivent dans une vieille maison à l'écart d'une ville perdue encerclée d'un énorme mur. C'est dans cette vieille maison que Rakka nait déjà adolescente d'un cocon géant. Rakka n'a aucun souvenir de son existence précédente mais seulement d'un rêve qu'elle a fait lorsqu'elle se trouvai dans le cocon. Essayant de s'adapter à cette situation, Rakka va découvrir qu'être Haibane n'est pas si facile qu'il y a certaines règles à respecter.

Dotées d'ailes et d'une auréole tels des anges, les Ailes Grises (ou Haibane) vivent dans une vieille maison à l'écart d'une ville perdue encerclée d'un énorme mur. C'est dans cette vieille maison que Rakka nait déjà adolescente d'un cocon géant. Rakka n'a aucun souvenir de son existence précédente mais seulement d'un rêve qu'elle a fait lorsqu'elle se trouvai dans le cocon. Essayant de s'adapter à cette situation, Rakka va découvrir qu'être Haibane n'est pas si facile qu'il y a certaines règles à respecter.