Août 1980. Après le premier pèlerinage de Jean-Paul II en Pologne, les travailleurs commencent des grèves contre le régime. Le père Jerzy Popiełuszko arrive pour célébrer la messe des ouvriers. Le prêtre comprend les revendications des ouvriers, les aide et participe à la contestation de Solidarność. Mais la loi martiale est proclamée dans le pays. Varsovie est occupée par des chars et les grèves sont brutalement réprimées. Le père Jerzy devient témoin de la grande manifestation d’indépendance des travailleurs polonais, mais aussi de la répression dramatique exercée par la police. Dans ses homélies, il parvient à exprimer ce que les gens pensent mais ne peuvent pas dire. Ses paroles deviennent le guide d’une nation en révolte. Les fidèles qui viennent l’écouter sont de plus en plus nombreux tandis que la police politique tente de l’intimider…

Dans la Pologne de 1987, dans un monastère coupé du monde, les moines gèrent une clinique pour possédés. Un jour, un jeune policier vient au couvent. Se faisant passer pour un ecclésiastique, il pénètre dans la vie monastique et tente d'expliquer la récente et mystérieuse disparition de plusieurs détenus tourmentés. Il s’avère cependant qu’il n’y a aucun moyen de sortir du monastère...