Le récit de Sword of the Stranger se déroule dans le Japon de l'ère "Sengoku", en pleine période de guerres civiles. Un rônin sans nom sauve un jeune orphelin, Kotarô, et son chien Tobimaru, lors d'un incendie. Pendant ce temps, une mystérieuse milice venue de Chine recherche Kotarô dans le but de l'utiliser pour accomplir un rituel occulte procurant la vie éternelle. Parmi eux se trouve Luo-Lang, un bretteur émérite assoiffé de combats aux ordres du seigneur de guerre Bai-Luan. Kotarô engage alors le rônin sans nom comme garde du corps en échange d'une pierre précieuse qu'un moine lui a donné, et ils décident de faire route ensemble. A partir de cet instant, leurs destins vont être inexorablement liés. Débute alors une émouvante histoire d'amitié entre deux individus ayant connu de nombreuses tragédies dans leurs vies personnelles : un samouraï sans maître et sans nom qui a juré de ne jamais retoucher à un sabre, et un jeune garçon qui a perdu ses parents.

Masaatsu Naito (Kuranosuke Sasaki) termine avec succès le Sankin-kotai (rituel requis pour visiter le shogun). Sur le chemin du retour, il apprend qu'une insurrection de paysans a eu lieu dans sa ville natale de Yunagaya. Masaatsu Naito sait que c'est une contre-attaque de Matsudaira. Il revient à Yunagaya, mais constate que son château a disparu.

Mumon est un fainéant mais également le meilleur ninja de la province d'Iga. Un jour, il reçoit l'ordre de tuer un ninja d'une autre famille en échange d'une certaine somme d'argent. Il ignore que cette action va mener les ninjas d'Iga dans une guerre contre l'armée du seigneur de guerre Oda Nobunaga.

À cause du travail de son père, Kaoru Nishimi déménage à Sasebo, préfecture de Nagasaki, au Japon. Il est un étudiant de première année de lycée avec une personnalité introvertie. Il rencontre ses camarades de classe Sentaro Kawabuchi, qui est étiqueté comme un étudiant désordonné, et Ritsuko Mukae, qui est une étudiante très mignonne. Kaoru Nishimi tombe amoureux de la belle Ritsuko Mukae. Kaoru Nishimi a du talent au piano, mais il ne joue que des classiques. Pour séduite Ritsuko Mukae, Kaoru Nishimi commence à jouer du jazz.

Karin Oriyama, 16 ans. Elle est au lycée et... elle est sur le point de se marier ! La personne qu'elle épouse est son premier amour Nao Tsurugi (Kento Nakajima). Il est un senior populaire au lycée. ... Karin l'aime vraiment, mais Nao ne l'aime pas du tout. Leur mariage est un secret, mais Isuzu Ebina (Yuri Chinen), qui a des sentiments pour Karin, est au courant.

Concert du groupe Hey! Say! JUMP

Concert du groupe Hey! Say! JUMP

Concert du groupe Hey! Say! JUMP

Kanzo Hattori, dit Nin, l'un des derniers descendants du clan des Iga, est envoyé à Tokyo par son père, le grand maître Hattori, afin d'accomplir son destin de ninja. Mais à Tokyo, il croise la route du jeune Kenichi, qui lui sauve la vie. Nin prête alors allégeance à Kenichi et entreprend un combat sans merci contre le clan rival des Koga, pour protéger son jeune maître...