Mamiya Hibiki, un mécanicien de 26 ans, vit avec sa petite amie Ogasawara Kurumi, une interne en médecine qu'il fréquente depuis le lycée. Alors qu'il est sur le point de la demander en mariage, il se retrouve pris en piège dans un tunnel qui s'est effondré. Lorsqu'il parvient à s'en sortir tant bien que mal quatre jours plus tard, il se retrouve dans une ville dévastée, parsemée de cadavres et envahie de zombies. Tandis qu'il se met à la recherche de Kurumi, il découvre que la zone a été coupée du reste du monde mais croise le chemin de quelques survivants.

En 1985, alors que le détective Kyogoku Kosuke (Karasawa Toshiaki) traquait des criminels, il s'est soudain retrouvé au centre d'une explosion et est tombé dans le coma. En 2015, après 30 ans, Kosuke se réveille et a beaucoup à rattraper, de nouvelles valeurs, technologie, famille, travail, tout ce qu'il a manqué. De retour à la Division criminelle, Kosuke et son nouveau partenaire Ryota se décide d'enquéter sur un groupe terroriste Schiesser.

Lorsque Takuma Kakinouchi a eu 8 ans, il a été hospitalisé. À l'hôpital, il se lié d'amitié avec Mayu Taneda qui avait le même âge que lui. Un jour, les enfants sortent de l'hôpital et vont au parc. Ils se promettent alors de se marier ensemble lorsqu'ils seront grands. Mais le destin en a décidé autrement puisque Takuma apprend qu'il est atteint d'une maladie rare au coeur et qu’il ne vivra probablement pas jusqu'à l'âge de 20 ans... Sept ans plus tard, Takuma entre dans le lycée prestigieux de Shido, à l'âge de 15 ans. Lors de la cérémonie d'accueil du lycée, la représentante des élèves de première année monte sur l'estrade. Takuma est choqué de voir que cette fille est Mayu Taneda ! Juste pour pouvoir être avec Takuma, Mayu a étudié extrêmement dur pour entrer à Shido. Cependant, Takuma essaie de l'éviter au mieux, même s'il l'aime, afin qu'elle souffre le moins quand il disparaîtra...