Mei est une fille un peu garçon manqué qui aide ses parents à tenir une baraque de nouilles. Elle se chamaille souvent avec Kento, un de ses camarades de classe qui est en fait secrètement amoureux d'elle. Un accident va emporter ses parents mais Mei reste déterminée à vivre toujours la même vie et à continuer de faire tourner le restaurant familial. Pourtant, Rihito, un "majordome" mais aussi le frère de Kento, vient lui annoncer qu'elle est la petite-fille d'un richissime homme d'affaires et qu'elle doit désormais se rendre dans la prestigieuse école de St Lucia. Cet établissement luxueux et démesuré n'accueille que des filles de bonnes familles qui peuvent se permettre d'en payer les frais d'inscription d'un montant exorbitant. Celles-ci sont de plus accompagnées en permanence par un "majordome" qui veille à accomplir leurs moindres désirs. Mei refuse d'abord de se rendre dans cette école mais les menaces qui pèsent désormais sur elle l'obligent à se plier aux ordres de son grand-père qui veut la forcer à devenir une "lady". Elle va donc fréquenter cette école où elle reçoit un accueil plus que froid de la part des autres élèves mais où Rihito va tout faire pour l'aider. Kento, inquiet pour Mei, va décider de devenir lui aussi "majordome" pour rentrer à Ste Lucia et garder un œil sur elle.

"Yankee-kun to Megane-chan" raconte l'histoire entre Daichi Shinagawa, délinquant du lycée, et Hana Adachi, représentante de classe à lunettes. Bien qu'ils puissent sembler opposés, Hana était autrefois une délinquante légendaire à l'époque où elle fréquentait le collège. Maintenant, Hana tente d'amener Daichi à changer ses habitudes pour le mieux...

Toru est un jeune travailleur à temps partiel qui ne s'intéresse pas aux questions sociales. Il est appelé comme juré dans le procès d'une femme étiquetée comme "sorcière", accusée d'un meurtre pour obtenir un énorme héritage. Bien qu'il semble qu'elle soit la coupable, un par un les jurés commencent à voter pour "non coupable". Dans l'ombre, une mystérieuse organisation achète le contrôle du jury. Au même moment, des événements étranges commencent à se produire autour de Toru. Lorsqu'un autre juré est menacé, Toru est déterminée à la sauver. Cependant, la petite amie de Toru, une journaliste, semble se méfier de leur relation. C'est alors que Toru commence son combat solitaire pour la vérité.

Après que sa mère Kanako a quitté la maison alors qu'elle était encore toute petite, Serizawa Hitomi a été élevée par son père Kensuke, patron d'un restaurant de sushi à Tsukiji. Elle travaille désormais dans une agence immobilière et est fiancé avec le médecin Sonoda Yuichi. Leur mariage est prévu pour dans un peu plus de trois mois lorsque Hitomi apprend qu'elle est atteinte d'une tumeur au cerveau. Sa mère profite de la situation pour faire sa réapparition.

Début du XXe siècle dans la préfecture de Fukui. Akiyama Tokuzo est le deuxième fils d'une famille relativement aisée mais n'arrive pas à trouver sa voie. Son père, exaspéré par ses échecs successifs et notamment son dernier dans un monastère, choisit, malgré son relatif jeune âge, de le marier à la fille d'une famille de marchands d'une ville voisine. Tokuzo est ainsi forcé de travailler dans le magasin de sa belle-famille mais la situation se passe plutôt bien au début. Il s'entend bien avec sa femme Toshiko et le travail ne lui déplait pas. Il fait cependant la connaissance de Tanabe, le cuisinier d'un camp militaire proche, qui va l'initier à la nourriture européenne. Épaté par les saveurs qu'il découvre, Tokuzo commence à mettre de côté son travail pour apprendre auprès de Tanabe. Mais s'il veut devenir le meilleur cuisinier du Japon comme il en rêve désormais, il n'a d'autre choix que de partir à Tokyo, avant même d'aller éventuellement encore plus loin.

Ashiya Mizuki est une jeune japonaise qui a vécu en Californie. Son idole, Sano Izumi, un champion de saut en hauteur, est un jour blessé à cause d'elle et arrête le sport. Prise de remords, Mizuki décidera d'intégrer son lycée pour qu'il reprenne le saut. Mais ce lycée n'est pas banal : c'est un internat qui n'accepte que des beaux garçons et qui est constitué de 3 dortoirs qui s'affrontent lors de compétitions pour gagner des prix. Mizuki doit donc cacher sa véritable identité, tout en essayant de remotiver Izumi.

Wakaba rêve de devenir un avocat international. Elle obtient pour cela un emploi au cabinet d'avocats Samezima Sakuragawa. Mais sa boss lui confie inopinément la garde de sa fille de 5 ans, Hatana. Wakaba, d'abord réticente, accepte après avoir appris que c'est pour seulement trois mois.

Hayashida Aiko est une femme mariée âgée de 51 ans qui va tomber enceinte. La grossesse, au départ, tenue secrète va finir par être révélée. Autour d'Aiko, de nombreux changements vont se faire à l'annonce de cette nouvelle. Ceux-ci toucheront principalement sa famille. L'histoire raconte l'impact qu'aura cette grossesse sur ses quatre enfants : Manami, Taichi, Koji et Miko. La vie banale de cette famille va donc considérablement changer à l'annonce de cette grossesse.

TOKYO MER a été créé sur ordre du gouverneur de Tokyo. Le nom du groupe signifie TOKYO Mobile Emergency Room (salle d'urgence mobile de Tokyo). Les membres sont des professionnels des soins d'urgence et ils doivent se rendre sur les sites d'accidents dangereux et de catastrophes en voiture d'urgence. Leur voiture d'urgence est un grand véhicule équipé des appareils médicaux les plus récents et d'une salle d'opération. C'est là que TOKYO MER sauve la vie des blessés.