Le monde est tourmenté par Shocker, une mystérieuse organisation terroriste, qui recrute ses agents en kidnappant des personnes qu'ils transforment en mutants cyborgs. Takeshi Hongo, l'une des victimes, se rebelle juste avant la phase finale de sa transformation. A l'aide de ses nouveaux pouvoirs, il décide de combattre Shocker...

L'histoire est centrée sur la façon dont une personne de 35 ans change l'école et influence la vie de ses camarades de classe. Et ce tout en faisant face à la sombre réalité des lycées d'aujourd'hui, y compris l'intimidation et l'école buissonnière.

Kouga est une sorte de samouraï des temps modernes. Son travail est tenu secret aux yeux des humains "normaux". Il doit chasser les "horrors" des démons qui se servent des humains pour subsister. Mais un jour, Kaoru une jeune artiste peintre se fait toucher par le sang d'un horror. C'est là que les ennuis commencent pour elle...

Jabami Yumeko est élève dans l'établissement un peu particulier de Hyakkaou au sein duquel existe un système de caste basé sur les talents des élèves dans les jeux de hasard. Sous ses airs discrets, Yumeko cache en fait une redoutable perspicacité, une mémoire d'éléphant et un sens de la manipulation à toute épreuve qui vont lui permettre de faire son chemin à Hyakkaou.

Un laboratoire de médecine légale a connu des temps difficiles en raison d'une pénurie de main-d'œuvre. Takashi Yuzuki est pathologiste au laboratoire médico-légal. Un jour, une chanteuse populaire meurt et une autopsie est demandée. Des entités puissantes sont derrière la mort de la chanteuse. Takashi Yuzuki tente de révéler la vérité.

Il y a quinze ans le patron d’une prestigieuse boutique de wagashi, confiseries traditionnelles japonaises, a été assassiné. Le témoignage de son tout jeune fils, Tsubaki, amène à l’arrestation d’une employée de la boutique.Hanaoka Nao, la fille de la suspecte, est désormais devenue une talentueuse artisane. En la revoyant pour la première fois quinze ans après les faits, Takatsuki Tsubaki tombe instantanément amoureux et, malgré l’opposition de sa famille, la demande en mariage le jour même sans savoir qui elle est vraiment. Nao saisit l’occasion pour pouvoir prouver l’innocence de sa mère.

L'histoire se passe un an avant que Yumeko ne soit transférée à l'Académie Hyakkaou. Saotome Meari, une jeune fille née dans une famille très ordinaire, a réussi ses examens de transfert et a commencé à fréquenter Hyakkaou. Cependant, l'école qu'elle s'attendait à fréquenter a une loi folle, Le baptême du jeu. Jumelé avec Yumeko comme son "jumeau", le rideau s'ouvre sur la manie du jeu de Meari !

Cette ville devrait vous sembler familière, mais soudain, elle ne l'est plus. Le chauffeur de taxi Odokawa a une vie très banale. Il n'a pas de famille, traîne rarement avec les autres et c'est un excentrique borné qui ne parle pas beaucoup. Les seules personnes qu'il peut appeler ses amis sont son médecin, Gôriki, et son camarade de classe du lycée, Kakibana. Tous ses clients semblent être eux-mêmes un peu bizarres. L'étudiant qui veut que le monde entier le remarque sur les réseaux sociaux, Kabasawa. Une infirmière et ses secrets, Shirakawa. Un duo comique qui ne s'arrête jamais, les Homosapiens. Un voyou local, Dobu. Un groupe d'idoles qui débute, les Mystery Kiss... Toutes ces conversations a priori banales finissent par mener à la disparition d'une fille...

L’hiver de son année de troisième, alors que Kiyomizu Minato rentre chez lui après avoir remporté un tournoi national de water-polo, un accident de voiture le plonge dans le coma. Lorsqu’il se réveille enfin 203 jours plus tard, il n’a plus aucun souvenir des trois dernières années. Il entre au lycée Yamanami dans l’espoir d’entamer une nouvelle vie loin du water-polo, mais suite à une promesse, il va replonger dans ce sport avec ses nouveaux amis. Malheureusement, le club de ce lycée est petit et bien des difficultés les attendent…

Lorsqu'une affaire ne peut être élucidée par manque de preuves, témoins, etc., elle est souvent abandonnée et mise au placard. Mais, grâce à une nouvelle branche de la Police Métropolitaine de Tokyo, ces affaires peuvent enfin être résolues ; c'est ici le but du Bureau Spécial des Investigations avec l'aide de la police scientifique. On découvre alors une toute jeune recrue, Izumi Sakuragi qui va découvrir un monde tout à fait différent de ce qu'elle avait connu précédemment... Entre la douleur des familles qui ont perdu un être cher, les témoins qui ne veulent plus parler, et les criminels qui sont toujours en liberté. Notre jeune héroïne réalise que la ré-ouverture d'un dossier plusieurs années plus tard révèle toujours des cicatrices profondes.

Après avoir provoqué un incident majeur, le policier Daigo Agawa emmène sa femme et sa fille vivre dans un village de montagne isolé, appelé Kuge. L’endroit semble parfait pour se remettre de l’épreuve, malgré la disparition mystérieuse d’un précédent officier affecté là-bas. Un jour, le corps d’une vieille femme est retrouvé dans la montagne. La famille Goto affirme qu’elle a été attaquée par un ours, mais Daigo remarque une trace de morsure humaine. Il devient vite évident que tout n’est pas comme il paraît dans le village.