Fate/Zero se déroule dix ans avant les évènements de Fate/stay Night qui raconte en détails ce qui s'est passé lors de la quatrième guerre du Saint Graal dans la ville de Fuyuki. À la suite de trois guerres sans vainqueurs, la quatrième guerre débute enfin… Cette guerre se fait affronter par les familles Einzbern, Matō, et Tōsaka depuis des siècles. Bien que Kiritsugu qui est au côté de Saber, ait longtemps désiré être un héros aux yeux de tous, il a définitivement abandonné le Saint Graal lorsqu'il a réalisé que ceci entraînait forcément la mort d'une autre vie. Pour le bien de l'humanité, il sera prêt à détruire quiconque se mettra en travers de la paix.

Illyasviel von Einzbern, surnommée Illya, a accompli la mission que lui avait confiée Rin Tôsaka : récupérer les Class Cards. Peu après, elle apprend tant bien que mal à faire la connaissance de Chloé, une fille qui lui ressemble étrangement ; mais toutes les épreuves passées paraissent être une partie de plaisir à côté de l'assaut de Bazett Fraga McRemitz, qui vient de raser le manoir des Edelfelt…

Misato Kurihara était un peu plus douée que les autres filles de son lycée et, en conséquence, elle était toujours seule et ne pouvait pas vivre sa vie comme elle le souhaitait. Après s'être réincarnée dans un autre monde en raison d'un tragique accident, elle veut s'y faire des amis et mener une vie normale. Elle a donc demandé à Dieu une chose : « Donnez-moi des capacités moyennes dans ce monde ! » Pas de chance, les capacités que Dieu lui a données n'étaient pas du tout « moyennes »…

Kôjirô Shindô travaille pour le ministère des Affaires étrangères. Tandis qu’il part en voyage d’affaires en avion, un mystérieux cube apparaît dans le ciel, absorbant l’appareil et tous ses passagers. Ce cube porte un nom : « Kado ». À l’intérieur, un être extraterrestre, Yaha-kui zaShunina, annonce qu’il va s’immiscer dans les affaires du Japon. Shindô endosse le rôle de médiateur, mais le gouvernement décide d’envoyer une femme, Saraka Tsukai...

Bienvenue à Kura, une organisation qui enquête sur des crimes en utilisant le Mizuhanome, un système percevant l'envie de tuer. Rencontrez Sakaido, un détective brillant qui pilote ce système. Pour résoudre les mystères, il pénètre dans le monde de l'inconscient des meurtriers : le puits de ça, généré à partir de leur envie de tuer. Dans l'ombre de brutales et énigmatiques affaires rôde John Walker, un tueur en série particulièrement dangereux. Où sa traque emmènera-t-elle les enquêteurs ?

Tous les dix ans, sept magiciens s'affrontent avec leur servant dans une guerre secrète afin de posséder le Saint Graal. À l'issue de ce combat, le magicien vainqueur aura le droit de voir un souhait exaucé. Emiya Shiro est un jeune lycéen ordinaire si ce n est qu'il est l'enfant adoptif d'un magicien très puissant décédé. Emiya ne possède pas le talent de son père mais cultive un pouvoir bien spécifique, celui de pouvoir réparer les objets. Seulement, le jour où il se retrouve aux prises d'un combat opposant deux magiciens, il va réveiller le pouvoir qui sommeille en lui sous la forme d'une jeune femme à la beauté aussi dévastatrice que sa puissance : Saber. L'ordre des sept magiciens est désormais réuni, la guerre peut commencer.

Nariyuki Yuiga vit sa dernière année de lycée, et c’est aussi la plus compliquée ! Afin de se voir attribuer une recommandation spéciale et ainsi obtenir une bourse universitaire, il doit donner des cours particuliers à ses camarades de classe qui peinent à préparer les examens d’entrée. Parmi ses élèves, il y a Fumino Furuhashi, la « Belle au bois littéraire dormant » et Rizu Ogata « la Petite Poucette superordinateur », deux des plus jolies génies en puissance de l’école ! Alors que ces deux dernières pensaient n’avoir aucune lacune, il s’avère qu’elles sont complètement larguées en dehors de leurs matières de prédilection ! Elles n’arrivent à rien et mènent la vie dure à Nariyuki qui doit tout faire pour qu’elles soient acceptées à l’université ! Découvrez une comédie romantique où les prodiges doivent faire des prouesses en matière d’études et d’amour !

Hakuno Kishinami se réveille sans aucun souvenir au beau milieu d'une guerre féroce dont l'enjeu est le Saint-Graal. Malgré sa confusion, il doit se battre pour survivre.

La division 35 de l’académie Anti-magie est une équipe de chasseurs de sorciers dont la mission est d’anéantir toutes les menaces magiques du pays. Malheureusement, cette escouade n’est composée que de ratés, aux personnalités instables et égo-centrées, incapables de coopérer lors de leurs missions. Ce manque d’harmonie leur vaut d’être la risée des autres divisions. Pour devenir les meilleurs de l’académie, il leur faudra surmonter leur plus grande faiblesse : leur manque d’esprit d’équipe.

Seishu Handa est un calligraphe très prometteur, mais il a aussi de la répartie ! Parce qu'il a assommé un conservateur de musée qui était critique envers son travail, le voilà puni, obligé d'aller se mettre au vert dans la campagne profonde du Japon. Au moins ce jeune homme de la ville pensait-il trouver le calme pour perfectionner son art, mais il n'est pas au bout de ses surprises...

Le vol du Saint Graal dans la ville de Fuyuki ouvre la voie à un monde parallèle où se déroule une guerre dévastatrice d'une ampleur sans précédent.

Vivy est la première Intelligence Artificielle humanoïde. Créée pour divertir les clients d'un parc d'attraction, sa vie bascule le jour où elle rencontre Matsumoto, une autre IA venant du futur. Ensemble, ils ont une mission capitale : rectifier le tir de l'Histoire et empêcher la guerre entre les formes d'IA et les humains… Vivy a 100 ans pour réussir !

Sept jeunes filles avaient une vie tranquille et ordinaire jusqu'à ce que leur monde se retrouve infesté de zombies. Dans cet environnement terrifiant dans lequel elles n'ont jamais souhaité se retrouver, elles partagent toutes le même souhait : continuer à vivre !

Hitomi, jeune lycéenne possédant le don de cartomancie, est téléportée malgré elle sur la planète Gaïa où elle fait la connaissance du roi Van Fanel du royaume de Fanélia et du chevalier Allen Schezar du royaume d'Astria. Tous deux luttent contre l'empire Zaïbacher à bord de leurs guymelefs : Escaflowne et Sheherazade. Hitomi se retrouve alors au cœur du conflit.

Aya Asagiri est une jeune fille persécutée aussi bien à son école qu'à sa propre maison. Alors qu'un jour, elle songeait à se suicider, une page d'un mystérieux site internet, Mahou Shoujo Site, s'est ouverte sur son ordinateur lui révélant qu'elle va être une Magical Girl !

L’histoire nous emmène dans la vie de Shirô Emiya, un jeune homme élevé par un mystérieux magicien après la mort tragique de ses parents. Shirô est devenu un lycéen solitaire capable de réparer les objets d'instinct et de lancer quelques sorts. Au cours d’une nuit mouvementé, il est entraîné dans une féroce bataille entre deux magiciens mais Shirô réussi à invoquer Saber, une redoutable épéiste pour le protéger. Il se retrouve alors dans une guerre impitoyable pour la quête du Saint Graal, une relique qui exaucerait les vœux.

À la suite d'un accident d'avion, un groupe de lycéennes échoue sur une île déserte. Sur place, il n'y a rien à faire, rien à manger, elles doivent se débrouiller toutes seules ! Mais elles ne se laissent pas abattre pour autant et vont apprendre à trouver de la nourriture (des crabes, des cigales…), faire du feu, construire des pièges et chercher des solutions pour sortir de là…

Tandis que des kaijus surgis de l'océan envahissent l'Australie, un ado et sa petite sœur pilotent un jaeger cabossé pour rechercher leurs parents disparus, et survivre.

Un matin, alors qu’elle se rend au lycée, Naho reçoit une drôle de lettre… une lettre du futur ! La jeune femme qu’elle est devenue dix ans plus tard, rongée par de nombreux remords, souhaite aider celle qu’elle était autrefois à ne pas faire les mêmes erreurs qu’elle. Aussi, elle a décrit, dans un long courrier, les évènements qui vont se dérouler dans la vie de Naho lors des prochains mois, lui indiquant même comment elle doit se comporter. Mais Naho a bien du mal à y croire, à cette histoire…

Quand des raisons personnelles poussent des amis de Yoon Tae-Oh à emménager chez lui, la maison devient le théâtre de leurs aventures sentimentales.