Aquafall est un monde paisible où l'eau et la nature foisonnent. Dans ce monde, les dragons et les fées vivent en parfaite harmonie jusqu'au jour où des météorites s'écrasent et laissent échapper des créatures maléfiques. Elles ont pour seul but de détruire tout être vivant qui habite cette planète. C'est à ce moment-là qu'une fée du nom de Syrup décide de constituer une alliance : « Force de défense d'Aquafall. » Elle demandera alors l'aide de trois jeunes filles, venues de différents clans de dragons, nommées Léviathan, Bahamut et Jörmungandr. Ces jeunes filles devront travailler main dans la main même si leurs caractères sont radicalement opposés.

Bienvenue à Asahigaoka, un petit village de campagne où Hotaru est venue s’installer avec ses parents, après avoir quitté Tokyo. Ici, l’école ne compte qu’une seule classe de cinq élèves aux âges différents.

En 2046, la technologie a fait naître le Neuro-Linker (dernière évolution du Nerve-Gear apparaissant dans Sword Art Online), un système qui permet à l'utilisateur de manipuler ses cinq sens pour accéder à une réalité augmentée et rechercher des informations sur Internet, mais qui permet aussi d'entrer dans un univers virtuel sous la forme d'un avatar choisit. Le jeune Haruyuki Arita, petit, gros, timide, est le souffre-douleur d'une bande de loubards de son collège. Son seul refuge, là où il se sent libre et doué pour quelque chose, se trouve dans l'univers virtuel du réseau de l'établissement, où il est le meilleur joueur d'un jeu de squash… jusqu'au jour où la plus belle fille de son école vient l'y trouver et lui donne rendez-vous dans le monde réel pour discuter. Une rencontre qui va bouleverser la vie de Haruyuki. Elle lui apprend en effet l'existence du monde accéléré et lui partage une application, le Brain Burst, qui s'installe directement dans le Neuro-Linker, mais qui implique certaines contreparties… Une nouvelle aventure, en tant que Silver Crow, commence alors pour Haruyuki dans le monde accéléré de Brain Burst.

Dorémi, une simple écolière, se dit être la fille la plus malheureuse du monde, jusqu'au jour où elle se dirige sans le savoir vers une boutique magique tenue par la sorcière Maggie grigri et sa fée Lala. Dorémi transforme sans le vouloir la sorcière en une espèce de petite grenouille verte, et pour la délivrer de ce sort, est obligée de devenir son apprentie-sorcière. Seule Dorémi aura le pouvoir une fois devenue sorcière de délivrer Maggie grigri de cette malédiction.

Il y a 15 ans, Hadlar, le Roi du Mal, qui terrorisait le monde avec ses hordes de monstres, a été vaincu par un grand héros. Libérés de ses maléfices, les monstres ont recommencé à vivre discrètement sur une petite île des mers du Sud, l'île de Dermline. C'est sur cette île que Daï(Fly) a été élevé, par son grand-père adoptif Brass. Daï(Fly), un jeune garçon de 12 ans, rêve de devenir un héros et de protéger l'île, alors que son grand-père, un sage incube d'environ 180 ans, veut à tout prix qu'il soit mage. Mais Daï(Fly) n'est pas doué pour la magie...

Takeshi Nanase est un lycéen ordinaire au passé sombre. Suite à certaines circonstances, il forme un « faux » couple avec son amie d'enfance, Kurumi Hisohima, toutefois, en dehors de cela, il mène une vie parfaitement normale. Mais un jour, il va rencontrer une jeune fille effondrée au milieu du campus scolaire, Mui Aiba, vêtue d'un uniforme qui lui est inconnu. Cette rencontre va complètement changer son destin. Mui lui explique qu'elle est une magicienne et s'excuse auprès de lui : pour une raison qui lui est inconnue, elle a également transformé le jeune homme en magicien ! Ce que Takeshi découvre alors est que ce qu'il croit connaître comme un seul monde en contient en réalité deux : le monde où vivent les magiciens et le monde où vivent les hommes.

Cinq cents ans se sont écoulés depuis que de mystérieuses « Bêtes » ont exterminé le genre humain et les animaux vivant sur Terre. Les rares survivants se sont installés sur des îles flottant dans les airs, hors de portée de ces terrifiantes créatures. Seules quelques guerrières, les Leprechauns, ont le pouvoir de résister à ces assaillants en maniant d’anciennes épées sacrées. Mais leur espérance de vie est courte, car la mort peut surgir à tout moment ! Willem a dormi plusieurs siècles dans la glace et est le dernier témoin vivant de cette catastrophe.

Après avoir éternué trop fort, Takebayashi Ryouma, un homme de 39 ans, se retrouve dans une étrange pièce blanche. Les dieux lui annoncent qu’il est mort et qu’ils vont envoyer son âme dans un monde différent, un endroit où la magie existe. Il se retrouve ainsi réincarné dans un corps de jeune garçon et, avec les bénédictions des dieux qu’il reçoit, développe des compétences en magie et de dompteurs de slimes. Après trois années à vivre seul dans une forêt, il rencontre la famille ducale Jamil qu’il aidera. Suite à cette rencontre, il voyagera ensuite avec cette famille à travers le royaume.

Miyako Hoshino est une étudiante timide et otaku. Un jour, son cœur s'emballe lorsqu'elle croise la route d'une bande d'écolières aux visages d'anges ! Elle essaie de leur parler, mais ne trouve pas les mots. Lorsqu'elle découvre un peu plus tard qu'elles sont dans la classe de sa petite sœur, elle va tout faire pour s'entendre avec l'une d'entre elles, Hana, qu'elle trouve vraiment trop mignonne…

En 2036, une partie de la Terre a été submergée par les océans à la suite d’une catastrophe naturelle. Aika Sumeragi est une jeune lycéenne insouciante et toujours en retard. Elle vient d'obtenir sa licence C de pilotage de sous-marin et compte bien monter son petit business dans le renflouage d'objets divers et variés. Eri, la déléguée de classe, lui propose de rejoindre le club des chasseuses de trésor et de partir à l'aventure à bord d'un sous marin miniature dernier cri.

Louise Françoise Le Blanc de la Vallière étudie la magie à l'Académie Tristein. Elle est surnommée Louise la Zéro et subit les moqueries de ses petits camarades car elle n'est pas capable de réussir un seul sort correctement. La tradition veut qu'en 2° année, chaque élève invoque un familier qui restera son compagnon à jamais. Alors que des familiers tous plus originaux les uns que les autres sont invoqués, Louise invoque un jeune garçon, Saito, qui dit venir d'un autre monde : le Japon. D'étranges évènements vont alors s'enchaîner qui semblent lui être liés.

À Los Angeles, le quotidien du service des urgences le plus trépidant de tous les États-Unis. Face à un système défaillant, les médecins tentent de protéger leur idéaux en respectant ceux qui ont le plus besoin d'eux : les patients. Leanne Rorish, une force de la Nature, est en charge de quatre résidents qui font leurs débuts dans le service...

Après s'être tuée au travail dans le monde réel, Azusa Aizawa s'est réincarnée en sorcière immortelle dans un autre monde où elle a passé 300 ans à profiter d'une vie paisible. Elle a pourtant tué des tas de Slimes pour payer ses factures et gagné de l'expérience, jusqu'à atteindre le niveau 99 ! Désormais, elle traîne une solide réputation qui attire aventuriers curieux, dragons duellistes et même une fille monstrueuse qui la prend pour sa mère ! Tout ceci ne fait pas ses affaires, elle qui aspire toujours à se la couler douce...

Il y a quelque chose de vraiment étrange avec la femme de chambre que je viens d'engager ! Aucune personne normale ne pourrait être aussi belle, ni cuisiner des plats aussi délicieux, ni savoir exactement ce que je veux avant même que je ne le demande. Elle doit sûrement utiliser la magie car seul un sort peut expliquer pourquoi mon cœur est si serré chaque fois que je la regarde. Je jure de découvrir ce qui rend cette femme de chambre si… mystérieuse !

L’informaticien Ichirô Suzuki, alias Satô, se réveille à l’intérieur du jeu vidéo qu’il était en train de programmer. Comme il connaît bien toutes les fonctions et les recoins du jeu, il se révèle très à l'aise dans ce monde. Cependant, il préfère rester discret à ce sujet et tandis qu’il part à sa découverte, il tente de venir en aide aux différents personnages qu’il croise.

Isolé de par les collines qui l’entourent, le village de Sotoba est véritablement coupé du monde. De ce fait, certains jeunes n’ont qu’une seule envie : quitter la région pour retourner à la ville et goûter aux joies de la modernité. Cependant, au moment où des étrangers viennent occuper l’ancien château abandonné qui surplombe le village, une succession de morts mystérieuses perturbe le calme habituel des environs. En effet, des personnes peu âgées et en parfaite santé semblent tomber subitement en anémie pour finalement mourir quelques jours plus tard. Alors qu’une possibilité de pandémie est supposée, certaines rumeurs répandent l'idée que la cause de tous ces drames pourrait en vérité trouver sa source dans des raisons à la fois obscures et surnaturelles…

Nous sommes dans un futur proche. Après avoir raté ses examens, Tsukasa Mizugaki, 18 ans, trouve un poste dans la prestigieuse SAI Corporation, grâce aux relations de son père. Cette société est spécialisée dans la production de Giftia, des androïdes très perfectionnés ayant des réactions proches des émotions humaines. Le travail de Tsukasa n'est cependant pas très gratifiant, puisqu'il consiste à récupérer les modèles arrivant en fin de vie.

Amnésique, Otonashi se réveille dans un lieu qui lui est inconnu. À peine conscient, une jeune fille nommée Yuri lui annonce de but en blanc qu’il est mort et qu’il se trouve dans l’au-delà. Cette dernière se présente comme le leader d’un groupe d’opposants tentant de défier les dieux par les armes afin de se venger des souffrances qu’ils ont endurées dans leur vie antérieure.

Un attentat terroriste frappe Tokyo et la police, confondue par l'énigme qui entoure les poseurs de bombes, ne peut rien contre la montée de paranoïa qui gagne la ville.