L'histoire commence dans un lycée où Makoto Ito est tombé amoureux d'une fille Kotonoha Katsura. Il la voit tous les jours dans le même train qu'ils prennent pour aller au lycée. Sekai Saionji, une amie qui est dans la même classe que Makoto, lui propose de l'aider, malgré ses sentiments pour lui...

À l’académie Koryo, on enseigne des techniques de combats à ceux qui sont nés avec certaines aptitudes appelées « Blaze ». Il s’agit d’une arme créée en matérialisant son âme et que l’on peut décupler en formant un Duo avec un partenaire. L’histoire tourne autour de deux étudiants qui n’ont pas tout à fait les mêmes pouvoirs que les autres élèves : Tor Kokonoe, dont le Blaze prend la forme d’un bouclier, et Julie Sigtuna, une mystérieuse jeune fille aux cheveux argentés qui forme un Duo avec lui…

Formée dès son plus jeune âge par son père apothicaire, Mao Mao est un jour vendue comme servante au palais de l'empereur. Prisonnière dans les arcanes du pouvoir, elle attire l’attention de Jinshi, un séduisant haut fonctionnaire qui la promeut lorsqu’il découvre son talent pour confectionner des potions. Désormais goûteuse, Mao Mao met ses connaissances au service des gens du palais pour les soigner, mais aussi pour déjouer les mystères et les complots qui se trament...

Hitori "Bocchi-chan" (la petite solitaire) Goto est une lycéenne introvertie qui ne vit que pour sa guitare. Chaque jour, elle ne fait rien d'autre que de gratter son instrument, toute seule à la maison. Cependant, sa vie change lorsqu’elle rencontre un jour Nijika Ijichi qui cherche une guitariste pour son groupe appelé "Kessoku Band".

Suite au coup d’État qu’a connu l’empire d’Arcadia, Lux, un ancien prince, a été condamné par le nouveau royaume à accomplir les basses besognes du peuple d’Atismata en échange de sa grâce. Un jour, par un mauvais concours de circonstances, il passe à travers un toit et se retrouve dans la salle de bain d’une école pour filles plutôt spéciale…

Un étudiant rejoint un club de magie et devient l'assistant d'une fille plus âgée, très mignonne mais un peu bizarre ! En effet, cette passionnée de magie perd tous ses moyens et rate ses tours lorsqu'elle monte sur scène…

Tadakuni est un jeune lycéen qui fréquente un établissement pour garçons. Il vit dans une charmante maison avec sa petite soeur et ses parents, et il souhaite comme tous les garçons avoir une petite amie. Toutefois sa vie est loin d’être tranquille ! Elle serait sans doute plus paisible, si ses deux amis, Yoshitake et Hidenori ne l'entraînaient pas la plupart du temps dans des situations plus que gênantes et des plans loufoques ! Entre ses amis qui squattent sans cesse son appartement, des essayages de vêtements féminins et des camarades de classe qui ne supportent pas de voir un de leurs confrères sortir avec une fille, le quotidien de Tadakuni et de ses amis est loin d’être aussi banal qu'il n'y parait.

Eikichi Onizuka, 22 ans, « célibataire, libre comme l'air », est un jeune professeur au passé douteux qui est nommé pour son premier poste dans une classe difficile ; il montre rapidement une vision de l'enseignement totalement décalée avec les pratiques habituelles. Ses réactions anticonformistes et directes, souvent humoristiques, sont l'axe central de cette série. Il va évoluer avec cette classe, dont la spécialité est de faire craquer moralement leurs professeurs, en tentant de la rallier peu à peu à sa cause.

Haruhi Suzumiya est une fille plutôt étrange, elle n’a qu’un seul but dans la vie : rencontrer des personnes de type paranormal, que ce soit des aliens, des voyageurs du temps, des exilés de l’espace… L’étrange l’attire et elle n’aime pas trop se mêler aux gens normaux. Kyon, lui, est un jeune lycéen devenu terre à terre après avoir réalisé que tous ces phénomènes paranormaux n’existent pas. Ce dernier va se retrouver finalement dans la même classe que Haruhi et il deviendra très vite, malgré lui, son acolyte dans toutes ses fantaisies. Fort heureusement, Haruhi arrivera à embrigader d’autres personnes afin de créer une organisation aux objectifs bien étranges : la Brigade SOS.

Alors que le plus grand assassin de l'époque est lui-même assassiné, il se réveille devant une déesse qui lui propose de le réincarner dans un autre monde. Cependant, elle a une condition : il doit assassiner le héros de cet autre monde. Ayant désormais un objectif précis, il se réincarne en tant que Lugh Tuatha, dernier-né de la lignée d'assassins de la famille Tuatha Dé.

Subaru Natsuki a basculé dans un monde fantastique où il fait la connaissance d’Émilia, une jeune fille aux longs cheveux d’argent qu’il jure de protéger. Malheureusement, le jeune homme ne résiste pas longtemps en se faisant tuer rapidement. Pourtant, il revient d’entre les morts, un phénomène qui se répète sans cesse, le ramenant toujours à son point de départ. Subaru entame alors un combat perpétuel dans lequel il essaie, peu à peu, de changer le futur...

Hikaru Tsuisui est un lycéen que l'on pourrait décrire comme un otaku. Il est tellement renfermé sur lui-même que ses camarades de classe ne le connaissent pas du tout. Il est un jour de corvée de nettoyage de la piscine scolaire avec la belle et désinvolte Igarashi Iroha qui est populaire auprès de nombreux garçons. Cette rencontre changera le cours de sa vie, mais de quelle façon ?

Hideki Motosuwa est un jeune étudiant qui vient de la campagne et qui monte à Tokyo pour préparer son examen d'entrée à l'université pour laquelle il a été recalé. Un soir, il trouve dans une poubelle un Persocon, une sorte d'ordinateur personnel qui a une allure parfaitement humaine. En l'occurrence, il s'agit d'un persocon avec le physique d'une très jolie jeune fille, sans aucun programme d'installé, donc complètement vierge (attention jeu de mot). Hideki va donc apprendre à Chii (c'est le nom du persocon : le premier mot qu'elle parvient à prononcer naturellement suite à son activation) progressivement à se comporter comme un humain... Jusqu'où cette relation va-t-elle aller ?

Sōta Tawara est un webdesigner travaillant à Tokyo. Pour ses vacances, il retourne dans sa ville natale éloignée de Tokyo afin d'y retrouver ses parents qui tiennent un restaurant de udon. Il y fera la rencontre d'un enfant qui ne peut pas parler mais qui est doté de deux étranges oreilles et d'une queue.

Cinq cents ans se sont écoulés depuis que de mystérieuses « Bêtes » ont exterminé le genre humain et les animaux vivant sur Terre. Les rares survivants se sont installés sur des îles flottant dans les airs, hors de portée de ces terrifiantes créatures. Seules quelques guerrières, les Leprechauns, ont le pouvoir de résister à ces assaillants en maniant d’anciennes épées sacrées. Mais leur espérance de vie est courte, car la mort peut surgir à tout moment ! Willem a dormi plusieurs siècles dans la glace et est le dernier témoin vivant de cette catastrophe.

Muni d'un gantelet démoniaque qui absorbe les âmes, un légendaire maître de sabre s'allie à une confrérie de samouraïs pour écraser une révolte de zombies assoiffés de sang.

Dotées d'ailes et d'une auréole tels des anges, les Ailes Grises (ou Haibane) vivent dans une vieille maison à l'écart d'une ville perdue encerclée d'un énorme mur. C'est dans cette vieille maison que Rakka nait déjà adolescente d'un cocon géant. Rakka n'a aucun souvenir de son existence précédente mais seulement d'un rêve qu'elle a fait lorsqu'elle se trouvai dans le cocon. Essayant de s'adapter à cette situation, Rakka va découvrir qu'être Haibane n'est pas si facile qu'il y a certaines règles à respecter.

Il y a trois ans, une brèche entre la Terre et le monde de l’au-delà s’est ouverte dans la ville de New York. Durant cette terrible nuit, New York a été détruite et reconstruite, piégeant les New-Yorkais et les créatures extra-dimensionnelles dans une bulle impénétrable. Rebaptisée Hellsalem’s Lot, la ville est un melting-pot paranormal où la magie et la folie vivent aux côtés de l’ordinaire, où chaque type de vermines humaines se rassemble pour exploiter le surnaturel. Quelqu’un menace de percer la Bulle et libérer les horreurs du Nouveau Jérusalem, mais les mystérieux supers agents de Libra se battent pour empêcher que l’impensable ne se produise.

Issu de l'union entre une humaine et un Yomu, Akihito est un adolescent doté d'un pouvoir de régénération lui permettant de survivre à n'importe quelle blessure. Alors qu'il marche près de son établissement scolaire, il aperçoit une jeune fille en haut du bâtiment semblant vouloir se suicider. Tandis qu'il essaie de l'en dissuader, celle-ci lui plante sans prévenir une épée en plein cœur. Ainsi fait-il la connaissance de Mirai Kuriyama, dernière héritière d'un pouvoir craint par l'ensemble des Yomu, celui de contrôler son sang et d'en faire une arme capable de tout anéantir. Toujours isolée depuis son enfance, Kuriyama est toutefois incapable de détruire les Yomu maléfiques en raison d'un incident du passé. Akihito tentera alors de lui faire surmonter son trauma en lui apportant le soutien qu'elle n'a jamais eu.

La série se déroule pendant la Seconde Guerre mondiale. Des monstres puissants nommés Siren apparaissent soudainement de la mer. Pour les contrer, une section de l'armée nommée Azur Lane est créée. Cette section est composée de jeunes femmes capables d'utiliser un système avancé d'armement naval ou d'aviation. Ainsi, elles réussissent à repousser les forces ennemies lors d'une attaque. La guerre est cependant loin d'être finie.