Un soir à Tokyo, les étudiants Yamane Mugi et Hachiya Kinu font connaissance après avoir raté tous les deux le dernier train à la gare de Meidaimae sur la ligne Keio. Partageant les mêmes goûts en terme de musique ou de cinéma, ils se rapprochent très vite et commencent à sortir ensemble. Après avoir fini leurs études, ils s'installent dans le même appartement tout en travaillant à temps partiel. Tandis que le célèbre centre commercial PARCO de Shibuya ferme ses portes, que l'émission SMAPxSMAP s'arrête après plus de vingt ans à l'antenne, leur petite vie de couple, agrémentée de l'adoption d'un chat abandonné, poursuit son train-train immuable pendant que les deux jeunes gens cherchent un emploi plus stable. Cinq années d'une relation qui malgré les apparences pourrait bien se terminer aussi soudainement qu'elle a commencé.

Masaya Kakei est étudiant à l'université, qui n'est pas son école idéale. Ses journées sont généralement sombres. Un jour, il reçoit une lettre du tueur en série Yamato Haimura, qui a été reconnu coupable de huit meurtres et a reçu la peine de mort. À l'époque où Yamato commettait ses meurtres, il dirigeait une boulangerie. À cette époque, Masaya était collégien et client de sa boulangerie. Selon la lettre, Yamato a avoué avoir commis les meurtres, mais il insiste sur le fait qu'il n'a pas commis le dernier meurtre. Masaya commence à enquêter sur la dernière affaire de meurtre impliquant Yamato.

Mika, infirmière le jour et hôtesse la nuit, et Shinji, ouvrier intérimaire dans le bâtiment, se rencontrent plusieurs fois par hasard dans Tokyo. Tokyo exacerbe en eux deux les mêmes angoisses : la peur de la mort, de la solitude, de la pauvreté. Leur rencontre va peut-être leur permettre de surmonter leur fatalisme.

XVIIème siècle, deux prêtres jésuites se rendent au Japon pour retrouver leur mentor, le père Ferreira, disparu alors qu’il tentait de répandre les enseignements du catholicisme. Au terme d’un dangereux voyage, ils découvrent un pays où le christianisme est décrété illégal et ses fidèles persécutés. Ils devront mener dans la clandestinité cette quête périlleuse qui confrontera leur foi aux pires épreuves.

Kosaka redouble sa terminale, il a la manie de ponctuer ses phrases d'un "je vais te tuer" ironique. En la voyant chercher le cadavre d'une abeille dans une poubelle pour aller l'enterrer dignement, il va se laisser attirer par Shikano, une fille de sa classe laissée à l'écart et qui passe son temps à se taillader les poignets. En parallèle, Jimiko tente de soutenir son amie Kyapiko qui multiplie les aventures amoureuses ratées, tandis que Nadeshiko n'arrête pas de déclarer sa flamme à un Yachiyo légèrement désemparé face à ces confessions quotidiennes.

Shinichi Tsuda, un auteur lauréat du prix Naoki, travaille à la publication de sa nouvelle histoire. Il tourne autour de Tsuyama, un chauffeur pour une entreprise de call-girl dans la préfecture de Toyama, qui tombe sur un mystérieux billet contrefait et dont la vie est ciblée par le chef de file de la pègre Kurata. Son histoire est-elle réalité ou fiction ? Son éditrice, Nahomi Torikai, décide de vérifier si son dernier ouvrage n'est qu'une fiction basée sur des expériences vécues. Elle se penche sur une famille qui a disparu, un employé de bureau de poste qui a disparu, un tas d'argent louche, où se trouvent les colombes et la rencontre fatidique de cette nuit-là... Une série de faits choquants sont révélés à partir des histoires de Tsuda. Pourquoi la fausse monnaie s'est-elle retrouvée entre les mains de Tsuda ? Quelle est la « fin » que Tsuda souhaitait représenter ?